salud
El Hospital Clínico consolida la implantación de la secuenciación genómica
El Servicio de Microbiología de este hospital de Zaragoza ha consolidado la secuenciación completa del genoma bacteriano con más de 90 cepas analizadas como método de control epidemiológico
El Servicio de Microbiología del Hospital Clínico Universitario Lozano Blesa de Zaragoza ha consolidado, un año después de su introducción por primera vez en Aragón, la secuenciación completa del genoma bacteriano (WGS), con más de 90 cepas analizadas en este tiempo como método de control epidemiológico de las resistencias bacterianas.
Según una de las miembros de este servicio de Microbiología, “puede parecer un número que no es muy grande, pero realmente, para nuestro entorno, es un número bastante elevado ya que son bacterias seleccionadas de pacientes muy concretos con unos perfiles de resistencia que no son frecuentes y que desde Vigilancia Epidemiológica se recomienda una vigilancia exhaustiva”, informa el Gobierno aragonés.
En concreto, el objetivo primero de esta técnica puntera es detectar genes relacionados con mecanismos de resistencia a los antibióticos, como beta-lactámicos, por la producción de carbapenemasas, y beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) o resistencia a vancomicina, que limitan considerablemente las opciones terapéuticas de las infecciones producidas por bacterias portadoras.
Se trata de “vigilar las bacterias que tienen unos genes que producen una resistencia a los antibióticos que se utilizan para tratar las infecciones, de forma que podamos estudiar esos genes y controlar mejor las infecciones”, señala Bueno, para quien “en función de los genes que tenga podremos seleccionar el tratamiento antibiótico más adecuado”.
Esta técnica se considera el mayor nivel de sofisticación para los laboratorios hospitalarios y constituye un proceso laborioso que se desarrolla a lo largo de 3-5 días en condiciones de seguridad biológica y cuya puesta en marcha ha requerido formación, entrenamiento, personal cualificado y equipamiento tecnológico.
Se trata de una técnica puntera que tiene aplicaciones en diversos campos de la Medicina, como la Genética o la Microbiología, campo este último donde puede ser aplicada al diagnóstico de las enfermedades infecciosas ya que permite identificar a un agente infeccioso, detectar cambios en su genoma y realizar comparaciones de su secuencia de ácido nucleico con otros agentes.
Herramienta fundamental en la pandemia
La aplicación de la secuenciación a la vigilancia de las resistencias bacterianas a los antibióticos ha sido la última incorporada a la actividad del Laboratorio de Microbiología, pero no la primera, ya que esta herramienta, de gran valor tanto clínico como epidemiológico, tuvo una notable importancia en el control de la pandemia del coronavirus.
En enero de 2021 la Comisión Europea publicó un comunicado instando a los países miembros a incrementar la tasa de secuenciación para mejorar la identificación y progresión de las variantes covid o detectar nuevas.
Pocos días después, el Ministerio de Sanidad estableció una red formada por centros autorizados para realizar la técnica de secuenciación en todas las comunidades, coordinada por el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCiii), con el objeto de obtener información compartida con centros españoles.
La técnica de secuenciación masiva fue introducida en la cartera de servicios del Servicio de Microbiología del Hospital Clínico en abril de 2021, y desde entonces se han secuenciado casi 1300 genomas de SARS-CoV-2 que han permitido detectar las VOC y conocer las variantes que circulan actualmente en nuestro medio: Ómicron BQ.1,1, BQ.1 y XBB-2.
