El archivo no tuvo nombre oficial, tal como hoy lo entendemos. Desde sus inicios se llamó Archivo Real, pues eso es lo que era:el que guardaba la documentación del rey. Y así fue conocido durante siglos. Desde el XVI, sin embargo, por tener los reyes otros archivos distintos, fue también corriente llamarlo Archivo de la Corona de Aragón. El nombre tuvo marchamo oficial a mediados del siglo XVIII: la primera vez que aparece con tal carácter es en una real cédula de 1754, en la que se daba un nuevo reglamento para el archivo.

Hay una corriente de historiadores y políticos que rechaza esta denominación como incorrecta, o incluso ‘impuesta’, y pretende establecer el nombre ‘Archivo Real de Barcelona’ como más genuino. No se trata de una mera cuestión de palabras: quienes defienden esta postura aspiran a crear una diferenciación entre lo que postulan sesgadamente como dos archivos diferentes: el ‘originario’ y el ‘llamado’ de la Corona de Aragón, que solo existiría como tal desde 1754; según tal planteamiento, este se iría configurando a partir de entonces con la incorporación de fondos dispersos con los que se ‘pretendía’ hacer del conjunto resultante un ‘verdadero’ Archivo de la Corona. La cuestión no es tan retorcida ni tan compleja: la denominación con la que se conoce al archivo refleja, simplemente, la diversidad y amplitud de su contenido, así como el periodo en el que estuvo vigente como institución activa.